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1.感染性腹泻：由细菌、真菌、病毒、寄生虫或食物中毒引起。
2.炎症性肠病：由直肠或结肠溃疡、肿瘤或炎症引起。
3.消化性腹泻：由消化不良、吸收不良或暴饮暴食引起。
4.激惹性或旅行者腹泻：常由外界的各种刺激所致。
5.菌群失调性腹泻：一般多因应用广谱抗生素引起的肠道菌群失调。
6.功能性腹泻：由精神因素引起。
不同的腹泻在用药上也有不同。感染性腹泻可以遵医嘱使用一些例如盐酸小檗碱（黄连素）或者喹诺酮类的抗菌药物。除了细菌、真菌感染引起的腹泻外，均不需使用抗生素治疗，可以服用一些药用炭、蒙脱石散等药品。此类药物本身不被吸收，口服后附着在肠壁，减缓肠蠕动，通过吸附作用减轻有害物质对肠壁的刺激保护肠粘膜而达到止泻效果。
此外，微生态制剂（活菌制剂）可补充生理性肠道益生菌，通过微生物的拮抗作用，抑制病原菌的生长和繁殖，维持正常肠蠕动，缓解腹泻症状。注意，活菌制剂服用水温应低于40摄氏度，否则菌素会失活。
腹泻严重者，往往会导致水份和电解质的大量丢失，引起脱水。治疗腹泻应充分补充失去的水份和电解质，口服补液盐是经济、简便、有效的治疗方式，防止急性腹泻所致的脱水。
出现腹泻症状，需要注意腹部保暖并保证充分休息。另外，腹泻不能不吃不喝，这样不利于病情缓解。通常腹泻者需要少食多餐，饮食清淡，营养均衡，如米粥、米汤、面条等；不要吃难消化的食物，如甜食、牛奶、豆类、汽水等，会引起腹胀腹痛。
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